公司体检中，以下情况通常会被认定为不合格：
血液疾病：
包括白血病、再生障碍性贫血、严重贫血等。
癫痫、精神病、癔症等精神疾病：
以及夜游症、严重神经官能症等。
性传播疾病：
如淋病、梅毒、艾滋病等。
听力障碍：
双耳听力有问题，且在佩戴助听器后耳语不能在3米以内。
器质性心脏病：
如风湿性心脏病、心肌病、冠心病等。
血压异常：
收缩压大于140mmHg和/或舒张压大于90mmHg。
视力问题：
裸眼视力低于0.4，矫正视力低于1.0。
血糖异常：
空腹血糖高于10.0摩尔/升。
肝脏功能异常：
谷丙转氨酶、谷草转氨酶、胆红素均明显升高，超过正常值2倍。
其他严重疾病：
如严重的心脏疾病、慢性阻塞性肺疾病、糖尿病、尿崩症、肢端肥大症等内分泌系统疾病。
传染病：
如活动性肺结核、艾滋病、梅毒等，若处于活动期且具有较强传染性。
严重的肾脏疾病：
如急慢性肾炎、慢性肾盂肾炎、多囊肾、肾功能不全等。
其他疾病：
如严重的肝脏疾病、风湿性关节炎、皮肌炎、硬皮病、结节性多动脉炎等。
需要注意的是，具体体检标准可能因公司政策和地区法律法规的不同而有所差异。建议在体检前仔细阅读公司的体检要求，并进行必要的预检。